El fondo SERPAJ da cuenta de la gran variedad de actividades que desplegó una organización ecuménica argentina en su lucha por la defensa integral de los Derechos Humanos en dictadura y en democracia, así como por la promoción de la cultura de la paz y la no violencia a través de las denuncias por desaparecidos y detenidos recibidas, la reunión de recortes de prensa para el procesamiento de información, sus declaraciones públicas y su comunicación interna, entre otros tipos de documentos.
La documentación testimonia las temáticas trabajadas por los programas y equipos que conformaron el SERPAJ Argentina. También evidencia los vínculos establecidos por la institución con otros organismos y organizaciones nacionales e internacionales así como su relación con los otros secretariados y su rol en SERPAJ América Latina, a partir de actas de reuniones, correspondencia, informes internos y comunicados de prensa.
Asimismo, gran parte de la documentación refiere a las actividades del Premio Nobel de la Paz, Adolfo Pérez Esquivel, fundador y presidente honorario de la institución.
Además de la documentación vinculada a la lucha por memoria, verdad y justicia, se destacan otras temáticas como educación, salud, niñez, género, pueblos originarios, ecumenismo, cultura de la paz y la no violencia, entre otros.