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Jorge Eduardo Auat nació en Santiago del Estero y estudió derecho en la Universidad Nacional de Córdoba. En 1996 fue designado Fiscal General ante la Cámara Federal de Apelaciones de Resistencia, provincia de Chaco. Intervino como fiscal en la causa por la masacre de Margarita Belén y en la causa del Regimiento de Infantería N° 9 de la ciudad de Corrientes, en las que se jugaron delitos de lesa humanidad. En el año 2007, el Procurador General de la Nación, Esteban Righi, lo designó al frente de la Unidad Fiscal de Coordinación y Seguimiento de las causas por violaciones a los derechos humanos cometidas durante el terrorismo de Estado, que en 2013 se transformó en la Procuraduría de crímenes contra la humanidad del Ministerio Público Fiscal.